Microscope polarisant est un autre type de microscope composé. ce qui peut améliorer le contraste et la qualité de l'image sur l'échantillon là où d'autres techniques telles que le contraste de phase ou le fond noir ne sont pas aussi efficaces. Deux filtres polarisants sont utilisés, appelés filtres « polariseur » et « analyseur ». Le polariseur est placé sur le trajet de la source lumineuse et l'analyseur sur le trajet optique. Les microscopes composés polarisants sont utilisés pour examiner les produits chimiques dans l'industrie pharmaceutique et les pétrologues et les géologues utilisent des microscopes polarisants pour examiner les minéraux et les fines tranches de roches.