Kính hiển vi phòng thí nghiệm, như kính hiển vi phức hợp cấp cao hơn, được thiết kế cho nghiên cứu trong phòng thí nghiệm, kiểm tra hàng ngày tại viện, viện nghiên cứu và đại học. Thông thường phòng thí nghiệm được thiết kế với vật kính phẳng hoặc hệ thống quang học vô cực, hầu hết chúng đều có thể nâng cấp với đầy đủ chức năng đính kèm, để quan sát trường tối, phân cực, tương phản pha, huỳnh quang, DIC, luyện kim.