Floresan Mikroskop floroforların uyarılmasına ve ardından floresan sinyalinin saptanmasına izin veren bir görüntüleme tekniği kullanır. Floresan mikroskoplar, ışığı istenen uyarma/emisyon dalga boyunda yansıtmak için güçlü bir ışık kaynağı (100W Cıva veya 5W LED) ve dikroik aynaya filtre küpleri gerektirir. Floresans, ışık bir elektronu daha yüksek bir enerji durumuna uyardığında veya hareket ettirdiğinde üretilir, hemen daha uzun dalga boyunda, daha düşük enerjide ve emilen orijinal ışıktan farklı renkte ışık üretir. Filtrelenen uyarma ışığı daha sonra numuneye odaklanmak üzere objektiften geçer ve yayılan ışık, görüntü dijitalleştirmesi için dedektöre geri filtrelenir. Diğer alanlarda olduğu gibi biyoloji ve tıpta da yaygın olarak kullanılmaktadır.