Microscope fluorescent utilise une technique d'imagerie qui permet l'excitation des fluorophores et la détection ultérieure du signal de fluorescence. Les microscopes à fluorescence nécessitent une source de lumière puissante (100W Mercure ou LED 5W) et un cube de filtre à miroir dichroïque pour réfléchir la lumière à la longueur d'onde d'excitation/émission souhaitée. La fluorescence est produite lorsque la lumière excite ou déplace un électron vers un état d'énergie plus élevé, générant immédiatement une lumière d'une longueur d'onde plus longue, d'une énergie plus faible et d'une couleur différente de la lumière d'origine absorbée. La lumière d'excitation filtrée passe ensuite à travers l'objectif pour être focalisée sur l'échantillon et la lumière émise est refiltrée sur le détecteur pour la numérisation de l'image. Il est largement utilisé en biologie et en médecine, ainsi que dans d'autres domaines.